Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P10404 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P10404 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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