Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms