Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms