Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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