Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamc1P02468 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamc1P02468 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms