Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CopeO89079 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CopeO89079 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CopeO89079 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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