Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms