Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sorl1O88307 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms