Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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