Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Stra6O70491 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Stra6O70491 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Stra6O70491 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Stra6O70491 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Stra6O70491 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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