Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnk2O54967 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnk2O54967 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnk2O54967 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnk2O54967 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnk2O54967 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnk2O54967 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnk2O54967 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnk2O54967 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms