Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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DffaO54786 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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DffaO54786 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DffaO54786 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffaO54786 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms