Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Limk2O54785 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Limk2O54785 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Limk2O54785 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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