Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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