Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ColqO35348 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ColqO35348 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ColqO35348 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ColqO35348 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ColqO35348 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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ColqO35348 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ColqO35348 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms