Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ArxO35085 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ArxO35085 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ArxO35085 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms