Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms