Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mrpl11-201ENSMUST00000025836 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Aldh8a1-201ENSMUST00000042699 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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