Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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