Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm933J3QPC1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms