Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm21900J3QP38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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