Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms