Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms