Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm3415J3QMS8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm3415J3QMS8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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