Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm11236J3QMS7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm11236J3QMS7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm11236J3QMS7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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