Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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