Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm21897J3KMP5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21897J3KMP5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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