Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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