Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610008E11RikG3X964 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms