Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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