Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm5861F6VCN9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5861F6VCN9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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