Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms