Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms