Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8882E9Q7E4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8882E9Q7E4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms