Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc85cE9Q6B2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms