Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
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