Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms