Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms