Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms