Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms