Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Defa28D3Z1V9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa28D3Z1V9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms