Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc170D3YXL0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc170D3YXL0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc170D3YXL0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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