Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms