Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc5C3VPR6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms