Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2B9EJA2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms