Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah3B2RWG3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms