Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap58B2RW38 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms