Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5483B2RV77 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms