Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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