Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms